Développer l’informatique de la biodiversité en Haïti : vers une meilleure connaissance de la richesse biologique du pays
Monday, 16 October 2017
Le projet, financé par le BID (Biodiversity Information for Development), est un partenariat entre le Jardin Botanique des cayes, Canadensys et GBIF. Un atelier de formation a eu lieu du 20 au 23 septembre 2017, au Jardin Botanique des cayes, regroupant des participants de tout le pays, incluant des représentants du Jardin Botanique National, du Jardin Botanique de Ouanaminthe et de l’Université Américaine des Caraïbes de la villes des Cayes.
L’atelier avait pour objectif de former les responsables de collection, les botanistes et les utilisateurs de données afin des les outiller et les rendre à même d’enrichir, de digitaliser et de publier les collections Haïtiennes. Un peu plus de 166 000 occurrences sont actuellement publiées sur GBIF, ce qui ne reflète aucunement la riche biodiversité de ce pays. De plus, bien que 29 pays publient des données sur Haïti, aucune occurrence n’est publiée directement par des institutions Haïtiennes.
Haïti fait partie du hotspot de biodiversité des Caraïbes, à l’intérieur duquel un haut taux d’endémisme est observé. Mais la biodiversité Haïtienne est vulnérable, et grugée par le développement humain, le manque de politiques de conservation claires et efficaces, et les catastrophes naturelles (tremblement de terre, ouragans). Afin de développer des plans et initiatives de conservation engendrant une meilleure protection de cette région biologiquement riche, les chercheurs et gestionnaires doivent avoir accès à des listes d’espèces et des inventaires des aires protégées.
Lors de l’atelier, les participants ont pu se familiariser avec GBIF et la communauté internationale de partage de données de biodiversité, et ont participé à des formations plus techniques sur la numérisation de spécimens, la gestion des données, les logiciels et outils de nettoyage de données, et la publication à travers l’outil de publication intégré (IPT) développé par GBIF. Une introduction aux applications du partage de données biologiques et aux analyses qui en découle a également été abordée, dans le contexte des questions et problématiques en Haïti.
Jour 1 – Introduction à GBIF et au Darwin Core
Au cours de cette 1ère journée, nous avons discuté du rôle de GBIF, des aggrégateurs et des noeuds à travers le monde. La seconde partie de la journée à été dédiée à la présentation du standard Darwin Core, en expliquant plus en détail l’organisation et la signification des termes les plus utiles et les plus importants.
Jour 2 – Numérisation et gestion des données
Lors de cette seconde journée, nous avons discuté de la numérisation, permettant de répondre aux questions des pourquoi et comment. Nous avons également présenté et discuté les différents outils de gestion des données et répondu aux questions sur la structure d’une base de données.
Jour 3 – Outils de nettoyage des données et de géoréférencement
La troisième (et dernière) journée de l’atelier général était dediée à la compréhension de l’utilité d’outils de nettoyage de données tel qu’OpenRefine, ou d’outils de géoréférencement tels que GeoLocate et l’API de Google Maps. Une présentation et une démo en direct d’OpenRefine et de ses fonctions a permis de montrer de quelle manière cet outil pourrait leur être utile dans la préparation et la standardisation de leurs données. Pour clore la journée, une présentation étape par étape de l’IPT a fourni aux participants toutes les connaissances nécessaires afin de publier leurs données sur GBIF.
Lien vers la présentation de Simon Joly sur l’utilisation des données de biodiversité
Jour 4 – Discussion et Exercices pratiques
Le dernier jour de cet atelier s’est fait en comité restreint avec l’équipe du Jardin Botanique des Cayes, afin de discuter plus précisément de la structure de leur base de données, des prochaines étapes du projet et de discuter quelle serait la meilleure manière pour eux de publier leurs données sur GBIF. Nous avons également commencé à travailler sur les données de l’herbier d’Eckman, afin de mettre en pratique les connaissances acquises pendant les journées précédentes.
Les fondations d’un grand projet Haïtien
Cet atelier et ce financement ne sont que le début d’un projet plus ambitieux imaginé par les responsables Haïtiens, menés par William Cinea, agronome et directeur du Jardin Botanique des Cayes. La volonté de construire, sur des bases solides, un programme de formation en biodiversité, ainsi qu’une initiative pan-Haïtienne de collecte de données biologiques, permettra au pays de se doter des outils nécessaires à la protection de leur richesse biologique.
| Labels: | Collection management, Darwin Core, IPT, Workshops |
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